De tiener Pelle heeft ooit superkrachten gekregen nadat hij door een mier werd gebeten. Deze superkrachten gebruikt hij door als de superheld Antboy de misdaad te bestrijden in en rond het mooie Middellund. In deze derde en laatste film uit de serie besluit Pelle zijn Antboy alter ego een tijd op non-actief te zetten. Als hij nog een laatste actie uitvoert, krijgt hij plots concurrentie van een nieuwe, onbekende superheld. Pelle gaat onderzoeken wie deze Naamloze Held is. Ondertussen hoort hij dat zijn aartsvijand De Vlo na twee jaar gevangenschap weer op vrije voeten is en gaat werken voor de nieuwe directeur van het bedrijf Exofarm. Er staat een nieuwe vijand op, die ditmaal niet alleen Middellund, maar de hele wereld bedreigt.