Vietnam in de jaren zestig. Kapitein Willard van de American Special Forces krijgt van zijn oversten de delicate opdracht de opstandige Amerikaanse kolonel Kurtz op te sporen in de jungle en hem te elimineren. Kurtz lijkt te zijn doorgedraaid en heeft midden in het oerwoud een rijk gesticht waar hij als een soort priester-koning heerst. Willards zoektocht naar Kurtz wordt een tocht naar 'the heart of darkness'.