Mr. Fox en Mrs. Fox leiden een idyllisch ondergronds leven. Twaalf vossenjaren na de geboorte van hun zoontje Ash komen de instincten van Mr. Fox bovendrijven, iets wat het bestaan van hun hele dierengemeenschap in gevaar brengt. Om aan voedsel te komen, berooft Mr. Fox de boerderijen van drie verschillende boeren, terwijl hij aan Mrs. Fox had beloofd dit niet meer te doen. Mr. Fox is de drie domme boeren steeds te slim af, maar als ze voor de zoveelste keer worden beroofd, komen ze bij elkaar en smeden ze een plan. Ze willen de fantastische Mr. Fox voorgoed uit de weg ruimen. Maar hier laat Mr. Fox het niet bij zitten. Samen met onder anderen Badger, Rabbit en Weasel smeedt hij een plan om keihard terug te slaan.