Wanneer boosaardige wezens de mensheid en haar voortbestaan bedreigen, slaat Moeder Natuur terug met haar eigen ultieme wapen: Godzilla. Een verwoestende natuurkracht, die het in een heftige strijd zal opnemen tegen deze wezens. Joe Brody is een wetenschapper in Japan. Hij ontdekt als één van de eersten een afwijking in sonargegevens en is net met zijn onderzoek hiernaar begonnen wanneer de hel losbarst. Zijn stiefzoon Ford, een jonge marineofficier, probeert ondertussen terug te keren naar zijn gezin in San Francisco, waar zijn vrouw Elle, een verpleegster, haar handen vol heeft met het helpen van mensen in nood.