Nadat een missie in Afrika is uitgelopen op een van zijn grootste catastrofes, trekt de stuntelige spion Johnny English zich terug in een Tibetaans klooster om naar zichzelf op zoek te gaan. Wanneer de Britse geheime dienst echter ontdekt dat de mysterieuze organisatie Vortex van plan is om een aanslag te plegen op het staatshoofd van China, wordt Johnny opnieuw ingeschakeld om de agenten van Vortex te ontmaskeren. In zijn onnavolgbare, catastrofale stijl neemt hij het op tegen dubbelagenten en een moordzuchtige schoonmaakster.