In het jaar 2089 worden op meerdere plaatsen op de wereld mystieke tekens gevonden die op een bepaalde plaats in het heelal wijzen. Een team onder leiding van Meredith Vickers en met wetenschappers en de androïde David, gaat naar een ver zonnestelsel om de oorsprong van de mensheid te onderzoeken. Op een afgelegen maan ontdekken ze een bergketen die niet op natuurlijke wijze ontstaan kan zijn.