Na al zijn spannende avonturen leidt de grote, groene oger Shrek een saai leven en is niemand meer bang voor hem. Diep van binnen verlangt hij terug naar de tijd dat hij iedereen angst inboezemde. Daarom sluit hij een deal met de duivelse Repelsteeltje. Vanaf dat moment is niets meer zoals het was. Shreks trouwe metgezel Donkey herkent hem niet meer, zijn grote liefde Fiona is veranderd in een harde verzetsstrijder en Puss in Boots heeft een flinke metamorfose ondergaan. Shrek heeft 24 uur de tijd om de Repelsteeltjes betovering te verbreken, anders zal deze eeuwig voortduren.