Priester John Geoghan wordt gearresteerd door de politie op beschuldiging van kindermisbruik. Niet veel later wordt hij alweer vrijgelaten en afgezet bij het aartsbisdom. Meer dan 25 jaar later krijgt 'Spotlight', het onderzoeksteam van de krant 'The Boston Globe', hoogte van het verhaal en ontdekt dat dit geen alleenstaand geval is. De medewerkers van de krant gaan op zoek naar bewijzen van een grootschalige doofpotoperatie van de Katholieke Kerk in Massachusetts. De zaak blijkt al snel groter en ingewikkelder dan gedacht. Tijdens de zoektocht naar de waarheid raakt de afdeling verwikkeld in een politiek spel, waarin ontdekt wordt dat niet alle betrokken partijen hetzelfde belang hebben.