Sinds de kwaadaardige Skeksis een machtig kristal in hun bezit hebben, heersen zij over de wereld. Ze hebben de van nature goede Gelflings gedood en alle andere wezens tot slaven gemaakt. Toch hebben twee Gelflings de slachtpartij overleefd: Jen, die opgroeide bij de alwetende Mystics en Kira, die zich schuilhield bij de Podlings in het moeras. Jen en Kira slaan de handen in elkaar om het kostbare kristal te vinden en de orde in hun wereld te herstellen.