1962, gedurende de Koude Oorlog. De dove schoonmaakster Elisa vindt op een dag, samen met haar collega Zelda, een visachtig wezen waarvoor ze snel empathie voelt. Dit wezen is de laatste van zijn soort en wordt door de Amerikaanse overheid gecontroleerd om eventueel ingezet te worden in het leger of de ruimtevaart. De overheid probeert hem verborgen te houden voor Rusland. Elisa wil het amfibisch wezen helpen ontsnappen uit het laboratorium.