In Silence witness neemt seriemoordenaar Arnold Mears (James Cosmo) vanuit de gevangenis contact op met alleenstaande moeder Annie Farmer (Rakie Ayola), wier dochter van zestien al lange tijd vermist is. Mears kickt op het manipuleren van mensen en krijgt haar zover dat ze botten opgraaft van slachtoffers waar de politie niets van afweet. Annie op haar beurt voelt zich verplicht de stoffelijke resten te vinden om zo de families van de slachtoffers rust te geven. Bovendien is ze ervan overtuigd dat Mears achter de verdwijning van haar tienerdochter zit. Haar zoon Andy ziet het met lede ogen aan. Hij roept de hulp in van Nikki om de resten die zijn moeder heeft opgegraven te onderzoeken. Als Annie verdwijnt, gaat Nikki de confrontatie aan met de seriemoordenaar.