The X-Files essential collection zendt de laatste aflevering van het elfde seizoen uit, wat voorlopig het slot is van de iconische scifi-serie. In deze aflevering komt de waarheid aan het licht over William, de zoon van Dana Scully (Gillian Anderson), die dankzij buitenaards DNA over bizarre bovennatuurlijke krachten beschikt. Lange tijd dacht agent Fox Mulder (David Duchovny) dat hij de biologische vader van de jongen was, maar de Cigarette Smoking Man doet een onthulling die alles op z'n kop zet. Maar voor het zover is, moet Mulder eerst de voortvluchtige William zien te vinden. Hij weet inmiddels dat hij dankzij z'n gaven het einde van de mensheid zal inluiden. Fox doet zijn best de jongen te helpen, maar William is overtuigd van zijn lot als doembrenger.