De mannen van het Amerikaanse Navy SEAL-team Six kregen het flink voor hun kiezen in het eerste seizoen van actieserie Six. Ze namen het op tegen nietsontziende terroristen in Afghanistan en leden van Boko Haram in Nigeria. Voor teamleider Rip Taggart (Walton Goggins) liep het niet goed af: in de laatste aflevering kreeg hij een moordaanslag te verduren. Bij de start van seizoen twee is het de vraag of hij deze aanval nog te boven komt. De rest van het team zint ondertussen op wraak en ontdekt dat een mysterieuze jihadleider genaamd The Prince verantwoordelijk is voor de aanslag op Rip. Ze bereiden een plan voor om hem in te rekenen, maar eerst neemt het gesteggel over wie de leiding over het team zou moeten hebben veel kostbare tijd in beslag.